蒼あおき空と、碧あおき海原──

物語の舞台は、こうした瀬戸内に浮かぶ小島

「祈背島いのせじま」と、
古より「コウミガミ」を奉まつる社

「巳重神社みかさじんじゃ」である。

そして時は、大正というひとつの時代が終わりに近づき、
何か新たな時代が訪れようとする、そんな節目の静寂なひと時を刻んでいる。

その神社では、代々兄妹が夫婦になる慣わしがあり、
これに叛くと祟りに遭うと恐れられていた。

しかし近代化が進むにつれ、近親者同士の相姦を忌み嫌う者も現れてくる──

そんな「コウミガミ」と「神蛇カンダ家」の人々との
血に纏わる物語がこれより綴られる──

神の怒りにふれた時、
人々は人知を超えた試練によって試される――

瀬戸内の小島「祈背島」≪いのせじま≫。

この島には、白蛇を多産の神"コウミガミ"として奉る
「巳重神社」≪みかさじんじゃ≫があり、宮司を務める神蛇家は
その蛇神の望みとして言い伝えられている"兄妹婚"を代々慣わしとしていた。

破れば下るという蛇の罰を恐れて――

現在、宮司を務めるのは「神蛇 丞」。

先代である父が流行病でこの世を去ってすぐ跡を継いだものの、
父を亡くしたことで精神を病んだ母「神蛇 鏡佳」の世話に、
妹の「神蛇 玲」と二人、頭を悩ませていた。

そんなある日、学者を名乗る「柳本 国定」が神社を訪ねて来る。

彼は民間伝承を研究しており、
この神社の奉神"コウミガミ"に纏わる伝承について調べに来たのだった。

一方で丞は、父が実は蛇の罰を受けたことで命を落としたという
噂が巷で広まっていることから、それらの伝承を疎ましく思っており、
柳本をつい追い返してしまう。

同日、鏡佳の妹であり、丞の初恋の人「九鬼 零佳」も現れ、
泊まり込みで家事を手伝いたいと申し出て来るが、
突然の事に丞は零佳を不信に思う。

まさか宮司が代替わりした隙をついて、
この神社を乗っ取る気ではないのかと……

玲の頼みもあり受け入れることになるが、不信感は晴れぬままだった。

そんな彼らを、一匹の白蛇が見つめる。

それは血のように赤い瞳を妖しげに煌かせて、
この世ならざる者の雰囲気を纏っていた。

「……再度創め、終わらせようぞ……」

地を這いずるようなその冥い声は、
彼らの日常の終焉と共に、すぐ傍まで迫っていた――