小さな頃､慣れ親しんだ祖父の家の庭園。久しぶりにそこを訪ねた主人公は､
荒れ果てた花園を見て愕然とする。

花園の世話を出来なくなった祖父に変わって､その花園を立て直すことになる
主人公。だが、その花園は､花の妖精たちが住む不思議な場所だった…。

『花暦』は、荒れ果てた花園に花を植え､育て､立派な庭にしていくことで､花の精と仲良くなることが出来る育成型シミュレーションゲームです。
花園には3人の花の精が住んでおり､彼女たちは久しぶりに訪れた若い人間(=主人公)に興味を示します。花の精たちは外の世界を見たがっていますが､彼女たちの力の源である花園は荒れ果てており､外出に耐えられるだけの体力を持っていません。

花園に新たな花を植え､育て､花園の花の力を上げることで､花の精たちは､少しずつ遠出が出来るようになります。
一緒に外出することで､人間のことを知っていく花の精､そして人間に無いものを彼女たちに見出していく主人公。その先に､どのような結末が待っているのでしょうか。